Ein Phänotyp kann durch unterschiedliche genetische Mechanismen zustande kommen.

Als Beispiele die Farbe weiss im Fell oder auch die bei Malinois Welpen bekannte Ataxie. Bei der Ataxie gibt es unterschiedliche Gendefekte, die zum Ausprägen der Ataxie führen.
Auch Degenerative Myelophatie ist ein Beispiel für HETEROGENIE. Als Risikofaktor für die Entwicklung einer DM wurde eine Mutation im Exon 2 des SOD1-Gens bei vielen Rassen nachgewiesen. Bei Berner Sennenhunden gibt es zusätzlich eine Mutation im Exon 1 dieses Gens, die ebenfalls mit der DM in Zusammenhang steht. Man kann davon ausgehen, dass auch bei anderen Rassen andere Mutationen zu DM führen können, da auch Hunde an DM erkranken, die frei oder als Träger auf die Mutation im Exon 2 getestet wurden.